Ученые из Сколтеха нашли способ остановить «лабораторного агрессора»

В лабораториях Сколтеха обнаружили вирус, способный годами выживать на оборудовании и срывать эксперименты, уничтожая культуры кишечной палочки. Исследователи под руководством Артема Исаева расшифровали молекулярный механизм «неуязвимости» фага KanT1 и предложили метод защиты, который поможет сохранить чистоту биологических проб.

Вирус KanT1, выделенный из воды в Калининграде, оказался крайне живучим: он проходит сквозь фильтры и не боится стандартных методов дезинфекции. Анализ генома с помощью нейросети AlphaFold3 позволил ученым раскрыть функции белков, которые до этого оставались загадкой. Ключевой находкой стал редкий SH3-домен, который ранее встречался только у вирусов, атакующих грамположительные бактерии. У фагов, поражающих кишечную палочку, такая структура обнаружена впервые.

По словам студентки НИУ ВШЭ Арины Ереминой, именно этот белок позволяет вирусу агрессивно разрушать клетку изнутри, обеспечивая быстрое распространение по лаборатории. Сравнение с 500 родственными геномами подтвердило, что SH3-домен есть у трети подобных фагов, что делает его мощным эволюционным инструментом. Чтобы противостоять этой угрозе, команда исследователей предложила использовать штамм кишечной палочки HS. Лабораторные тесты показали, что этот штамм обладает полной устойчивостью к T1-подобным фагам и может стать надежным барьером против случайных заражений.